1、農(nóng)村居民未經(jīng)或者騙取批準(zhǔn)非法占用農(nóng)村土地新修建的房屋；此類房屋，根據(jù)《土地管理法》第七十七條規(guī)定，將拆除非法占用土地上新建的房屋。
2、房屋的宅基地面積超過省，自治區(qū)，直轄市規(guī)定的標(biāo)準(zhǔn)建，此類房屋僅確權(quán)合理登記范圍的宅基地面積，多余的宅基地原則上交予農(nóng)民朋友繼續(xù)使用，待房屋翻新、重建時將收回多余宅基地。
3、買賣或者以其他形式非法轉(zhuǎn)讓宅基地上修建的房屋，《土地管理法》第二條和第七十三條就明確規(guī)定：禁止買賣或者非法轉(zhuǎn)讓農(nóng)村土地，對違反土地利用總體規(guī)劃擅自將農(nóng)用地改為建設(shè)用地的將拆除土地上的建筑設(shè)施。
4、擅自在耕地以及基本農(nóng)田保護(hù)區(qū)修建的住宅，目前國家正在大力保護(hù)農(nóng)村的耕地，想要在耕地上修建房屋，必須要獲得農(nóng)用地轉(zhuǎn)為建設(shè)用地的審批手續(xù)，而且國家明令禁止基本農(nóng)田保護(hù)區(qū)修建房屋，所以此種情況其房屋也不能夠確權(quán)登記。
1、房屋的矛盾一般都是由侵權(quán)引起的，房屋在分配的時候就已經(jīng)完成了確權(quán)行為，村里都會有原始記錄。如果有爭執(zhí)的話，可以調(diào)取房屋原始記錄查看，關(guān)于誰侵權(quán)就一目了然了，因此不需要再次確權(quán)了。
2、農(nóng)村的房屋一般都是大家統(tǒng)一申請確權(quán)，政府和法院不會單獨受理某個村民的房屋確權(quán)。在分房屋的時候確權(quán)已經(jīng)由土地管理部門按戶確權(quán)清楚了，并且會做好相關(guān)登記，所以原則上，法院和政府都不會再受理單獨的確權(quán)申請。
3、一般的房屋只要交易雙方自己同意就可以，但是農(nóng)村的房屋不一樣，不僅要雙方同意，還要經(jīng)過村委的同意才能交易，此外農(nóng)村房屋交易之前要明確房屋確權(quán)。經(jīng)過村委同意后，就可以開具相關(guān)證明，然后才能辦理過戶等手續(xù)。
